控制和预防本病是卫生防疫工作的一项长期的重要任务。在采取以灭鼠防鼠为主及对高发病区及其他疫区的高危人群大力推行疫苗接种的综合性措施的同时，各级政府应地一般性预防措施给予足够重视，加强组织措施，农、林、水利、交通、城乡建设等有关部门要积极配合，充分发挥爱国卫生运动委员会和卫生职能部门的作用，广泛深入地开展宣传教育，认真抓好以下措施的落实。
　　1.食品管理、消毒和个人防护
　　1.1食品管理
    要搞好食品卫生、食具煮沸消毒、食物保藏等工作。在本病疫区，特别是家鼠型疫区，除开展灭鼠工作外，要防止鼠类排泄物污染食品和餐具。剩饭菜必须加热或蒸煮后食用。在疫区严禁以鼠肉为食。在住室保藏粮食时，切勿暴露堆放地面或床下，应储存在严密无缝的木箱或缸内，并加盖，以防止鼠类侵入污染。
　　1.2加强消毒
    在病家及医院对发热病人的血、尿和宿主动物的血液、唾液、排泄物及其污染器物，以及鼠尸等，均应及时进行消毒，妥善处理，防止污染环境。常用消毒药有3%~5%甲酚皂溶液（来苏儿）、0.1％苯扎溴铵（新洁尔灭）和含氯石灰（漂白粉）等。
　　1.3注意个人防护
    医疗、防疫部门对疫区居民应做好本病的防治知识的宣传工作，使人人皆知EHF的危害、症状和预防办法。
　　2.实验室感染的预防
    实验室内饲养野鼠和大白鼠混入带HV鼠时最容易引起实验室感染，必须引起高度警惕和重视。
　　2.1感染的原因
    用鼠做病毒分离或传播试验，缺乏负压安全饲养柜等隔离防护措施；负压安全饲养柜高效滤器尘埃堵塞，起不到负压作用；饲养员及实验人员吸入带病毒气溶胶或经伤口接触感染。
　　2.2防制感染的措施
    疫区无负压安全饲养柜的实验室严禁饲养野鼠和大白鼠等易感动物进行活毒试验；大白鼠等实验动物的饲养场，要防止野鼠窜入；对实验动物要定期（半年或1年）检测抗原、抗体；做好灭虫、通风和湿式清妇；器物、污水、污物应严格消毒处理；用细胞培养分离病毒、培养病毒换液或操作感染材料要等在负压安全超净台内进行，工作人员按无菌操作及安全防护要求着装，对病毒污染及时进行消毒；对实验室工作人员要经常进行安全教育，确保安全操作。